Впервые диссертационный совет по трем специальностям (6D071200 Машиностроение, 6D071900 Радиотехника, электроника и телекоммуникации, 6D075100 Информатика, вычислительная техника и управление, 6D071800 Электроэнергетика) в вузе был создан в 2017 году.
В мае 2019 года приказом председателя Комитета по контролю в сфере образования и науки МОН РК в СКУ им. М. Козыбаева открыты диссертационные советы по специальностям:
1. 8D07103 (6D071800) Электроэнергетика, 8D07101 (6D071200) Машиностроение.
Председателем совета является ассоциированный профессор, доктор технических наук Савинкин Виталий Владимирович.
Заместитель председателя – доцент, PhD, Ратушная Татьяна Юрьевна.
2. 8D06201 (6D071900) Радиотехника, электроника и телекоммуникации, 8D06101(6D075100) Информатика, вычислительная техника и управление.
Председателем совета является кандидат технических наук Демьяненко Александр Валентинович.
Заместитель председателя – профессор, кандидат технических наук Савостин Алексей Александрович.
Приказом председателя Комитета по обеспечению качества в сфере образования и науки МНВО РК от 14 июля 2023 года №344 в СКУ им. М. Козыбаева открыт диссертационный совет по специальности:
3. 8D07102 Химическая технология органических веществ
Председателем совета является профессор, к.х.н., заведующий кафедрой «Химия и химические технологии» НАО «Северо-Казахстанский университет им. М. Козыбаева» Дюрягина Антонина Николаевна
Заместитель председателя – к.х.н., профессор кафедры «Химия и химические технологии» НАО «Северо-Казахстанский университет им. М. Козыбаева» Масалимова Бакытгуль Кабыкеновна